In Silico PCR & Молекулярний аналіз QT-EVE-GH-003 SCHEMATIC / EMPIRICAL
Схематичний режим (Schematic Mode): Координати та шкала наведені відносно заявленої довжини амплікону.
Геномні координати BED заблоковані до надання верифікованої референсної послідовності.
Загальна характеристика ампліфікаційної системи
Цільова мішень:
Cotton
Cotton
Тип методу:
Quantitative PCR method for detection of cotton event MON1445 (EURL GMFF, 2017)
Quantitative PCR method for detection of cotton event MON1445 (EURL GMFF, 2017)
Статус у реєстрі:
EURL GMFF Validated
EURL GMFF Validated
Довжина амплікону:
87 bp
87 bp
Аналіз референсної послідовності (кероване обчислювальне завдання)
Відносна схематична топологія праймерів (Schematic Topology Map)
Прямий праймер (Forward)
Послідовність (5' → 3'):
GGAGTAAGACGATTCAGATCAAACAC
| Довжина: | 26 nt |
| Nearest-Neighbor Tm: |
62.4°C
(SantaLucia 1998, 50mM Na+, 1.5mM Mg2+) |
| Емпірична оцінка Tm: | 56.4°C (MARMUR_DOTY_EMPIRICAL) |
| Вміст GC: | 42.3% |
| Евристика шпильок / димерів: | LOW |
Зонд (Probe)
Послідовність (5' → 3'):
Не вказано
| Довжина: | 0 nt |
| Nearest-Neighbor Tm: | Н/Д |
| Емпірична оцінка Tm: | 0°C (NONE) |
| Вміст GC: | 0% |
| Флуорофор / Гасник: | Unspecified (Schematic) |
Зворотний праймер (Reverse)
Послідовність (5' → 3'):
ATCGACCTGCAGCCCAAGCT
| Довжина: | 20 nt |
| Nearest-Neighbor Tm: |
67.4°C
(SantaLucia 1998) |
| Емпірична оцінка Tm: | 55.9°C (MARMUR_DOTY_EMPIRICAL) |
| Вміст GC: | 6E+1% |
| Ризик шпильок / димерів: | LOW |